云南科技出版社自建社以来，始终坚持把握正确的出版方向，坚持为社会主义服务、为人民服务的出版方针。以科技出版为己任，探索出一条地方出版社“专、精、特”的办社之路。出版的图书以专业学术类图书为核心（生物科学、环境科学、有色金属、地震研究、医药科研等），以“三农图书”为支柱，以云茶、云花、云烟、云宝、云药、禁毒防艾类图书为市场品牌的出书结构。
云南科技出版社每年出版图书300余种，累计出版图书4000多种，其中500多种次图书获得包括全国三大奖在内的省部级以上各类图书奖励。其中两本学术专著获得2007年第一届新闻出版总署“三个一百”原创图书奖。
云南科技出版社把出版好“三农”图书作为神圣职责，从运作机制上给予扶持，三农图书的内容突出地方特色，现阶段可供“三农”图书品种400多种，10多个系列，在云南省形成了品牌效应。其中《农村日用大全》为2006年中宣部、新闻出版总署、农业部推荐的150种“三农”优秀图书之一。2004年被新闻出版总署评为全国服务“三农”先进出版单位，2006年被新闻出版总署评为全国新闻出版行业服务社会主义新农村建设出版发行先进集体。2006年12月被国家人事部、新闻出版总署授予全国新闻出版系统先进集体。
云南科技出版社以坚持提高图书质量为中心，成立了图书质量领导小组，下设图书质量监督部。出台了相关的图书质量保障体系规章制度，责任编辑发稿前签订编辑图书质量保证书，坚持图书出版三校一读制。明确规定重印图书印前审读制，做到全社每年图书编校质量抽查制等，使全社图书质量逐年上升。多年来未出版过一本内容质量有问题的图书。
云南科技出版社于1985年成立，1993年7月独立经营时开办资金10余万元，在没有教材教辅作为经济支柱的情况下，通过实施精品战略和图书选题结构的调整，从图书内容的宣传推荐到发行销售网络的拓展延伸，云南科技出版社运用自己的能力和优势，拓展自己的市场份额，使云茶、云花、云烟、云药、云宝、禁毒防艾等特色图书成为优势品牌。
《毒品预防读本》一书，通过内部征订和对外推广齐头并进 ，于1998年始累计发行逾400万册。
2004年以来找准市场空白点，大力出版普洱茶类图书，三年累计出版60多种，发行码洋近3000万元，其中40多种图书反复重印，累计版权输出18种。《云南普洱茶》、《普洱茶 续》、《品味普洱》等评为全行业优秀畅销品种。
云花类图书一直是云南科技出版社优势品牌图书，紧紧围绕云南花卉产业策划图书，从云南的鲜切花到兰花、山茶花等形成品牌。《滇兰经典系列》、《云南山茶花》等获全行业优秀畅销品种表彰。
《云南天然药物图鉴》已出版第一卷、第二卷、第三卷、第四卷。根据市场需求，立体开发，同时发行简易本，形成我社的长版长销书。民族医药类也是我社的重点版块，已出版《彝药本草》、《云南彝医药》（上、下卷）、《云南藏医药》、《纳西东巴医药研究》、《傣医药治疗丛书》、《香格里拉民族药图鉴》、《云南常用中草药单验方荟萃》等图书。
珠宝类图书的策划，注重培育珠宝消费者，从普及珠宝知识入手，内容性强，定价低，与同类图书相比发行量大，每本珠宝图书都畅销，有的版权卖到韩国和台湾地区。
烟草类图书自1985以来，共累计出版400多种，从烟草育苗、栽培、粗加工、收购、精加工、科研专著等方面，力争做到面面俱到。
现阶段“三农”图书两个效益明显，可供品种400余种十几个系列，除了系统内征订外，市场销售业绩稳定。
